1.住房公积金贷款利率低于商业银行。
2.贷款对象有不同的要求。公积金的贷款对象需要是公积金制度的缴存人；商业贷款不需要公积金储户。
3.对贷款人年龄的不同限制。一般来说，商业银行个人住房贷款是有年龄限制的；公积金住房贷款没有年龄限制。
4.商业银行的住房贷款最高可达住房总价的80%，住房公积金贷款最高可达住房总价的95%或90%，视所购住房的性质而定。
5.贷款担保不同。商业银行贷款一般采用房地产许可证抵押登记前开发商的阶段性连带责任担保方式，抵押登记后采用抵押担保方式；公积金贷款担保的方式主要是北京市住房贷款担保中心提供的连带责任担保。
6.所需费用不同。商业银行住房贷款一般需要律师费和保险费；住房贷款担保中心办理住房公积金住房贷款一般只需要担保费和评估费。
